MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003552	T	6	6	260902	260907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_003552	AAGG	2	8	261036	261043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_003552	AAAG	2	8	261046	261053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_003552	GCA	2	6	261072	261077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_003552	A	6	6	261127	261132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_003552	GTC	2	6	261276	261281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089114
5007	NC_003552	CTT	2	6	261326	261331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089114
5008	NC_003552	GA	3	6	261386	261391	50 %	0 %	50 %	0 %	20089114
5009	NC_003552	TA	3	6	261399	261404	50 %	50 %	0 %	0 %	20089114
5010	NC_003552	GAG	2	6	261459	261464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089114
5011	NC_003552	TCT	2	6	261829	261834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089114
5012	NC_003552	TC	3	6	261964	261969	0 %	50 %	0 %	50 %	20089114
5013	NC_003552	GGC	2	6	262074	262079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089114
5014	NC_003552	GAG	2	6	262143	262148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089114
5015	NC_003552	CTC	3	9	262172	262180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089114
5016	NC_003552	CTA	2	6	262205	262210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089114
5017	NC_003552	TCA	2	6	262219	262224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089114
5018	NC_003552	TGG	2	6	262231	262236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089114
5019	NC_003552	GTCC	2	8	262298	262305	0 %	25 %	25 %	50 %	20089114
5020	NC_003552	GTT	2	6	262355	262360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089114
5021	NC_003552	T	6	6	262420	262425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_003552	TTG	2	6	262431	262436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_003552	T	7	7	262441	262447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_003552	ATT	2	6	262487	262492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_003552	ATT	2	6	262524	262529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_003552	TTA	2	6	262563	262568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_003552	TGT	2	6	262579	262584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_003552	ATT	2	6	262647	262652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_003552	TAC	2	6	262684	262689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_003552	TA	3	6	262693	262698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_003552	TGG	2	6	262721	262726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_003552	A	6	6	262845	262850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_003552	TAT	2	6	262880	262885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_003552	TTA	2	6	262955	262960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_003552	GAT	2	6	262973	262978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089115
5036	NC_003552	GGA	2	6	263058	263063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089115
5037	NC_003552	ATATTC	2	12	263104	263115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20089115
5038	NC_003552	GCT	2	6	263127	263132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089115
5039	NC_003552	TTA	2	6	263191	263196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089115
5040	NC_003552	AAGC	2	8	263245	263252	50 %	0 %	25 %	25 %	20089115
5041	NC_003552	A	6	6	263310	263315	100 %	0 %	0 %	0 %	20089115
5042	NC_003552	CTC	2	6	263410	263415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089115
5043	NC_003552	CCT	2	6	263465	263470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089115
5044	NC_003552	TTC	2	6	263504	263509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089115
5045	NC_003552	A	7	7	263532	263538	100 %	0 %	0 %	0 %	20089115
5046	NC_003552	TGA	3	9	263617	263625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089115
5047	NC_003552	CAG	2	6	263705	263710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089115
5048	NC_003552	GTC	2	6	263711	263716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089115
5049	NC_003552	GAA	2	6	263718	263723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089115
5050	NC_003552	TCCT	2	8	263724	263731	0 %	50 %	0 %	50 %	20089115
5051	NC_003552	GGA	2	6	263996	264001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089116
5052	NC_003552	GAAA	2	8	264140	264147	75 %	0 %	25 %	0 %	20089116
5053	NC_003552	A	6	6	264145	264150	100 %	0 %	0 %	0 %	20089116
5054	NC_003552	TAT	2	6	264157	264162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089116
5055	NC_003552	GGA	3	9	264212	264220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089116
5056	NC_003552	AAT	2	6	264271	264276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089116
5057	NC_003552	CTG	2	6	264285	264290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089116
5058	NC_003552	GT	3	6	264343	264348	0 %	50 %	50 %	0 %	20089116
5059	NC_003552	GAG	2	6	264401	264406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089116
5060	NC_003552	GC	3	6	264408	264413	0 %	0 %	50 %	50 %	20089116
5061	NC_003552	AG	3	6	264434	264439	50 %	0 %	50 %	0 %	20089116
5062	NC_003552	CTT	2	6	264464	264469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089116
5063	NC_003552	CAGG	2	8	264648	264655	25 %	0 %	50 %	25 %	20089116
5064	NC_003552	TGAT	2	8	264691	264698	25 %	50 %	25 %	0 %	20089116
5065	NC_003552	TTGAA	2	10	264804	264813	40 %	40 %	20 %	0 %	20089117
5066	NC_003552	T	7	7	264856	264862	0 %	100 %	0 %	0 %	20089117
5067	NC_003552	CTT	2	6	264876	264881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089117
5068	NC_003552	GTGC	2	8	264911	264918	0 %	25 %	50 %	25 %	20089117
5069	NC_003552	CAC	2	6	264944	264949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089117
5070	NC_003552	AGA	2	6	264955	264960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089117
5071	NC_003552	CTT	2	6	265162	265167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089117
5072	NC_003552	CATG	2	8	265198	265205	25 %	25 %	25 %	25 %	20089117
5073	NC_003552	ACC	2	6	265227	265232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089117
5074	NC_003552	AAG	2	6	265299	265304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089117
5075	NC_003552	TCGCT	2	10	265445	265454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5076	NC_003552	TTG	2	6	265525	265530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089118
5077	NC_003552	TCC	2	6	265537	265542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089118
5078	NC_003552	T	7	7	265604	265610	0 %	100 %	0 %	0 %	20089118
5079	NC_003552	TGG	2	6	265645	265650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089118
5080	NC_003552	CAA	2	6	265651	265656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089118
5081	NC_003552	GCT	2	6	265674	265679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089118
5082	NC_003552	TGCC	2	8	265701	265708	0 %	25 %	25 %	50 %	20089118
5083	NC_003552	GGA	2	6	265747	265752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089118
5084	NC_003552	CAA	2	6	265798	265803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089118
5085	NC_003552	GCA	2	6	265839	265844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089118
5086	NC_003552	GAG	2	6	265969	265974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089118
5087	NC_003552	CTTTT	2	10	265980	265989	0 %	80 %	0 %	20 %	20089118
5088	NC_003552	TCA	2	6	266007	266012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089118
5089	NC_003552	AGC	2	6	266166	266171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089118
5090	NC_003552	TCT	2	6	266181	266186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089118
5091	NC_003552	GCCGT	2	10	266187	266196	0 %	20 %	40 %	40 %	20089118
5092	NC_003552	GTG	2	6	266226	266231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089118
5093	NC_003552	TC	3	6	266234	266239	0 %	50 %	0 %	50 %	20089118
5094	NC_003552	TAT	2	6	266279	266284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_003552	T	6	6	266345	266350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_003552	CTGCA	2	10	266380	266389	20 %	20 %	20 %	40 %	20089119
5097	NC_003552	ATC	2	6	266435	266440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089119
5098	NC_003552	TA	3	6	266458	266463	50 %	50 %	0 %	0 %	20089119
5099	NC_003552	CCA	2	6	266489	266494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089119
5100	NC_003552	GATA	2	8	266535	266542	50 %	25 %	25 %	0 %	20089119
5101	NC_003552	GAAG	2	8	266544	266551	50 %	0 %	50 %	0 %	20089119
5102	NC_003552	AT	3	6	266594	266599	50 %	50 %	0 %	0 %	20089119
5103	NC_003552	AAGTTG	2	12	266655	266666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089119
5104	NC_003552	TGGT	2	8	266673	266680	0 %	50 %	50 %	0 %	20089119
5105	NC_003552	AAT	2	6	266779	266784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089119
5106	NC_003552	TTA	2	6	266787	266792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089119
5107	NC_003552	ATT	2	6	266807	266812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089119
5108	NC_003552	CTC	2	6	266845	266850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089119
5109	NC_003552	TTTA	2	8	266861	266868	25 %	75 %	0 %	0 %	20089119
5110	NC_003552	TTC	3	9	266894	266902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089119
5111	NC_003552	CTT	2	6	266914	266919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089119
5112	NC_003552	GCC	2	6	266978	266983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089119
5113	NC_003552	TAC	2	6	267043	267048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089119
5114	NC_003552	GAAA	2	8	267056	267063	75 %	0 %	25 %	0 %	20089119
5115	NC_003552	TCCGT	2	10	267102	267111	0 %	40 %	20 %	40 %	20089119
5116	NC_003552	T	6	6	267126	267131	0 %	100 %	0 %	0 %	20089119
5117	NC_003552	ATAG	2	8	267224	267231	50 %	25 %	25 %	0 %	20089119
5118	NC_003552	AAG	2	6	267259	267264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089119
5119	NC_003552	TCA	2	6	267339	267344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089119
5120	NC_003552	GTTT	2	8	267345	267352	0 %	75 %	25 %	0 %	20089119
5121	NC_003552	TGT	2	6	267451	267456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089119
5122	NC_003552	AAT	2	6	267460	267465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089119
5123	NC_003552	AGA	2	6	267509	267514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089119
5124	NC_003552	CTC	2	6	267604	267609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089119
5125	NC_003552	GAA	2	6	267648	267653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089119
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